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医药公司回扣是指医药公司向医院和医生提供一定的返利和福利，以获取更多的销售业务。影响到医生开具药品的选择，增加了临床使用药品的成本。
医药公司与医院、医生之间的回扣存在一定的合法性。根据《中华人民共和国反不正当竞争法》，政府不禁止企业之间的返利和优惠，只需要依法依规。但是，如果某些医生或医院利用回扣获取不正当收益的行为，就需要政府严惩。
医药公司的回扣对财务会计的影响较大。不当的披露和处理会导致企业面临很大的风险。因此，为了避免出现问题，企业需要在财务专业人员的支持下，严格管理与回扣相关的计算和披露过程。
首先，企业应当制定相应的制度和规范，保证回扣的披露和计算程序。并且，应当强调回扣应该是纯粹的商业决策，与医院、医生的关系分明。
其次，企业需要对回扣进行进行详细的账务处理。企业应当对所有回扣来源进行记录，并对所有的回扣进行分类披露。同时，企业应当建立专门的账户，以避免混淆回扣和其他的销售和财务业务。
企业有责任确保回扣是合法合规的，并且不会出现任何不道德的行为。如果企业在审计期间出现问题，就容易给合规性带来很大的风险。因此，企业应当在经营回扣业务时持续进行内部排查，以确保公司不会发生流于表面的业务操作。
以上是关于医药公司回扣如何做账的相关内容。企业在医药公司回扣业务的整个过程中，应当始终尽最大的努力，避免出现任何不良操作。这样才能够持续获取良好的商业口碑和证明。
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