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进项发票经税务机关核实后方可进行抵扣。目前，专用发票认证一般是通过在线远程认证系统进行自我认证。单位内未自行认证的，应到税务机关或中介机构进行认证。因此，企业会计应及时认证在规定的时间确定当月的进项税额。
一个企业每月收到的发票比较多，通常不是在一个月内全部认证，而是有选择认证部分的发票。在对发票进行认证时，需要考虑三个主要因素:
首先是当月的纳税金额。在税务机关规定的税负范围上、下当月计算税款;
第二，考虑核算库存和成本处理。有些商品是当月购买，当月销售的。这些发票应在当月进行核销，否则账面库存为负数。生产企业需要原材料进行成本核算。如果当月使用的生产材料发票没有认证，产品成本将会降低。
第三，发票是否到期。根据税法规定，发票应在填写发票之日起90天内进行认证(不同类型发票的有效期略有不同，详见上述《进项税额抵免期限规定》)。
因为大多数企业，尤其是商业零售企业，销售不开具发票，导致进项发票出现盈余，耽误认证。因此，企业在对发票进行认证时，应仔细核对每月的输入发票，先对即将到期的发票进行认证。
扩展信息:
一般纳税企业缴纳的主要税种是增值税。增值税通常的计算是用当月的销项税减去当月的进项税和当月的留存进项税。
增值税的计算比较简单，但控制起来比较复杂。企业要考虑当月产出发票的开具情况和进项发票的到货和证明情况，也要考虑税务机关对企业的税负要求。
为了控制企业增值税的缴纳，税务机关针对不同类型的企业制定了相应的税负，即全年应缴纳的增值税税额(计算方法见上一介绍)制止企业违法违规少缴增值税。
企业缴纳增值税的金额通常控制在税负标准线附近，有时略低于税负标准。各地的税收负担不同，执行力度也不同。企业应因地制宜，认真落实。
税务机关的税负标准是指企业全年完成的纳税要求。企业按月上缴税款低于或高于税负标准属于正常现象。但个别企业负责人在处理时往往比较“认真”，通过各种方式将每月增值税缴纳额控制在标准税负线内，这样的处理是没有必要的。
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